FileZilla是一款流行的、免費且開源的文件傳輸客戶端軟件，也支持Linux系統。它主要支持三種文件傳輸協議，以滿足不同的安全性和效率需求：

1. FTP (文件傳輸協議): 這是最基礎的文件傳輸協議，簡單易用，但傳輸過程不加密，安全性較低。

2. FTPS (FTP over ssl/TLS): FTPS是FTP的增強版，它在FTP的基礎上增加了SSL/TLS加密，確保數據傳輸的安全性。

3. SFTP (ssh文件傳輸協議): SFTP基于SSH協議，提供更高級別的安全文件傳輸服務。它不僅加密數據傳輸，還提供更強的身份驗證機制。

選擇哪種協議取決于您的安全需求和網絡環境。如果您需要安全的文件傳輸，建議使用FTPS或SFTP。